Studi italiani (Cnr di Avellino e Università di Salerno) hanno sviluppato un metodo innovativo per simulare le interazioni virali Abbiamo sviluppato una procedura bioinformatica. Spike proteine con anticorpi prodotti dal nostro organismo. Questo aiuta a spiegare l'elevata contagiosità di questa sottospecie
Perché l'Omicron è così contagioso? In Italia, le tecniche Sars-CoV sono state sviluppate per aiutarci a capire perché questa variante del - 2 virus si trasmette più facilmente rispetto ad altre varianti del virus. Lo studio, pubblicato sulla rivista Molecules, consentirà inoltre di prevedere l'impatto di nuove varianti virali sulle difese immunitarie già sviluppate. I ricercatori dell'Istituto di Scienze dell'Alimentazione (Isa) del Cnr di Avellino e dell'Università di Salerno hanno ideato un'innovativa procedura bioinformatica per simulare l'interazione della proteina spike della variante Omicron con gli anticorpi prodotti dal nostro organismo. Lo studio è nato da spunti di riflessione emersi dopo un incontro con il Centro di ricerca collaborativa della Commissione europea.
Questo studio ha approfondito lo studio della proteina spike del mutante omicron di Sars-CoV-2 con l'obiettivo di indagare due aspetti. Recettore Ace2, questo è il modo per entrare nelle nostre cellule. D'altra parte, per vedere se gli anticorpi sviluppati dall'organismo umano contro la precedente proteina spike mutante potessero in qualche modo "riconoscerla". Avevamo bisogno di realizzare una procedura bioinformatica automatizzata che potesse simulare i cambiamenti degli aminoacidi nelle proteine e abbiamo ottenuto un modello di interazione con anticorpi basati su modelli molecolari di oltre 150 picchi. - Analizzare i complessi anticorpali già noti nelle precedenti varianti del virus, analizzare le proprietà delle loro interazioni e come gli anticorpi sviluppati contro le varianti precedenti possono riconoscere o riconoscere nuove proteine spike. Sottolinea ciò che non puoi fare.
"Gli studi effettuati hanno dimostrato che molti anticorpi già presenti nel nostro organismo possono riconoscere anche la proteina spike della variante Omicron, sebbene con alcune differenze nelle interazioni molecolari formatesi. "Si vede", ha spiegato Angelo Facchiano (Cnr-Isa ), che ha diretto lo studio insieme ad Anna Malabotti dell'Università di Salerno. "Inoltre, studiando il meccanismo di interazione con il recettore Ace2, evidenziamo alcune differenze rispetto alle precedenti varianti della proteina spike e forniamo una possibile spiegazione per la facilità di trasduzione della variante Omicron.
Questo studio potrebbe hanno anche importanti implicazioni in termini di comparsa di nuove varianti. In effetti, la procedura bioinformatica sviluppata può essere utilizzata per simulare le sostituzioni di amminoacidi presenti in nuove varianti e fornire previsioni rapide. Effetti sulla capacità di protezione immunitaria fornita dagli anticorpi già presenti nel nostro organismo, sviluppati a seguito di vaccinazione o precedente infezione, di contrastare possibili nuove varianti.
"Questa procedura ha richiesto solo poche settimane dalla scoperta della variante omicron e dalla dichiarazione della variante preoccupante da parte dell'Organizzazione Mondiale della Sanità per ottenere risultati sulle interazioni anticorpali. Uno strumento che sarebbe effettivamente disponibile per il comunità scientifica in caso di nuove varianti di Facchiano ha concluso
Una rappresentazione schematica delle mutazioni presenti nella proteina spike del mutante Omicron del Sars- Virus CoV-2 (Fonte: Opabinia regalis su Wikipedia)
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